539遊戲的獎金非常誘人，不過首先玩家需要先了解兌獎時有哪些需要注意的事情，這樣不僅可以加快領獎的過程，同時也可以維護自身的權益。
當玩家成功中獎後，若是獎金低於新台幣5000元，可以直接到附近的實體彩券經銷商兌獎，不過若是獎金高於新台幣5000元，則需備妥中獎彩券及身分相關的證明文件，前往指定地點兌換獎金。
對中獎者來說，最重要的就是妥善保管中獎彩券，若是因彩券遺失、被盜或因火燻、水浸、油漬、塗染、破損等等，導致彩票無法辨識，那麼將無法兌獎，依規定這款遊戲以注為單位，同一組獎號同時中了兩個以上的獎項時，只能領取獎金最高的今彩539獎項。